17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2040 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2040  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3350  hypothetical protein  90.91 
 
 		 66 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.699781  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4003  hypothetical protein  86.36 
 
 		 66 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6095  hypothetical protein  72.73 
 
 		 68 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3260  hypothetical protein  69.7 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0517932  normal  0.319323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2347  hypothetical protein  68.18 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00811131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2726  hypothetical protein  65.15 
 
 		 66 aa  93.6  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1796  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1395  hypothetical protein  38.98 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1351  hypothetical protein  38.98 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.731742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  39.66 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1662  hypothetical protein  34.48 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754821  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  38.33 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  37.93 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  36.21 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1747  hypothetical protein  27.59 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>