18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2460 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1796  hypothetical protein  50.82 
 
 
61 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1351  hypothetical protein  52.46 
 
 
77 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.731742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1395  hypothetical protein  52.46 
 
 
61 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1662  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754821  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2040  hypothetical protein  39.66 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3260  hypothetical protein  43.1 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0517932  normal  0.319323 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  40.98 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1909  hypothetical protein  62.07 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1747  hypothetical protein  44.26 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3350  hypothetical protein  39.66 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.699781  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2347  hypothetical protein  44.83 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00811131  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2726  hypothetical protein  41.38 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4003  hypothetical protein  39.66 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2495  hypothetical protein  44.83 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6095  hypothetical protein  36.21 
 
 
68 aa  43.9  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  34.55 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>