17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4003 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4003  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3350  hypothetical protein  86.36 
 
 		 66 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.699781  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6095  hypothetical protein  80.3 
 
 		 68 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2040  hypothetical protein  86.36 
 
 		 66 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3260  hypothetical protein  74.24 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0517932  normal  0.319323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2726  hypothetical protein  68.18 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2347  hypothetical protein  68.18 
 
 		 66 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00811131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1796  hypothetical protein  44.07 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1395  hypothetical protein  42.37 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1351  hypothetical protein  42.37 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.731742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1747  hypothetical protein  34.48 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1662  hypothetical protein  36.21 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754821  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  39.66 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02634  hypothetical protein  35.59 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2495  hypothetical protein  32.76 
 
 		 68 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>