16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3260 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3260  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0517932  normal  0.319323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6095  hypothetical protein  78.79 
 
 		 68 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2726  hypothetical protein  80.3 
 
 		 66 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2347  hypothetical protein  80.3 
 
 		 66 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00811131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3350  hypothetical protein  75.76 
 
 		 66 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.699781  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4003  hypothetical protein  74.24 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2040  hypothetical protein  69.7 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1796  hypothetical protein  44.07 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1395  hypothetical protein  45.76 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1351  hypothetical protein  45.76 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.731742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  39.66 
 
 		 61 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1747  hypothetical protein  35.59 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1662  hypothetical protein  34.48 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754821  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2016  hypothetical protein  35.59 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  37.1 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>