11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2016 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2016  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1796  hypothetical protein  45.9 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1351  hypothetical protein  45.9 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.731742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1395  hypothetical protein  45.9 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2726  hypothetical protein  40.68 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3260  hypothetical protein  35.59 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0517932  normal  0.319323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1747  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2347  hypothetical protein  35.59 
 
 		 66 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00811131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6095  hypothetical protein  33.9 
 
 		 68 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3171  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>