21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2009 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  100 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  39.29 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  38.6 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  38.33 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  40 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  38.33 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  39.22 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  39.22 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  40 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  44.07 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  38.78 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  39.62 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0901  hypothetical protein  40.48 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.28384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  44.23 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  38.3 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  35.29 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  35.85 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  38.98 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  48.72 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>