28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3938 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  91.94 
 
 		 62 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  91.94 
 
 		 62 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  93.55 
 
 		 62 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  87.1 
 
 		 66 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000197115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  70.97 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4220  hypothetical protein  67.74 
 
 		 62 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000695961  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3292  hypothetical protein  69.35 
 
 		 62 aa  94.4  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341896  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3593  hypothetical protein  67.74 
 
 		 62 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000773085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0704  hypothetical protein  79.03 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000186245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0734  hypothetical protein  79.03 
 
 		 64 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00001969  hitchhiker  0.0032638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3650  hypothetical protein  77.42 
 
 		 62 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000159809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0725  hypothetical protein  77.42 
 
 		 62 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541071  hitchhiker  0.0000273453 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0749  hypothetical protein  69.64 
 
 		 56 aa  87.8  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000984241  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  67.74 
 
 		 62 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  61.11 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  57.14 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  56.36 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  51.61 
 
 		 62 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  49.15 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  52.94 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  52 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  38.71 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0359  hypothetical protein  48.78 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.246304  hitchhiker  0.00315014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0539  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.174202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  38.46 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  38 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  35.59 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>