46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00584 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  68.97 
 
 		 61 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  59.26 
 
 		 61 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  61.4 
 
 		 62 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  59.65 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  57.41 
 
 		 62 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  61.11 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000197115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  61.11 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  61.11 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3593  hypothetical protein  55.93 
 
 		 62 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000773085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  53.33 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  53.33 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3292  hypothetical protein  55.93 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341896  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  53.7 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0749  hypothetical protein  59.26 
 
 		 56 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000984241  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4220  hypothetical protein  51.67 
 
 		 62 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000695961  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  56.52 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0734  hypothetical protein  52.17 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00001969  hitchhiker  0.0032638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  47.06 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0704  hypothetical protein  52.17 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000186245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3650  hypothetical protein  52.17 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000159809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  42.37 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0725  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541071  hitchhiker  0.0000273453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0359  hypothetical protein  44.19 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.246304  hitchhiker  0.00315014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0539  hypothetical protein  54.05 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.174202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  46.15 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  39.29 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  40.74 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5104  hypothetical protein  45.83 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  46.81 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1827  hypothetical protein  48.84 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  46.81 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  41.51 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  44.9 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  45.24 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3717  hypothetical protein  43.59 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0761314  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6276  hypothetical protein  48.84 
 
 		 63 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1803  hypothetical protein  48.84 
 
 		 63 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0435  hypothetical protein  38.46 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.409321  unclonable  0.0000000247595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1603  hypothetical protein  38.64 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101159  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1097  hypothetical protein  42.5 
 
 		 50 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  47.62 
 
 		 61 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1825  hypothetical protein  42.5 
 
 		 50 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>