38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1741 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5104  hypothetical protein  98.41 
 
 
63 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1803  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206591  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6276  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579358  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1827  hypothetical protein  97.92 
 
 
63 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2218  hypothetical protein  88.89 
 
 
63 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1603  hypothetical protein  84.13 
 
 
63 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101159  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2532  hypothetical protein  80.95 
 
 
63 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00934487  hitchhiker  0.000016546 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1097  hypothetical protein  95 
 
 
50 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1825  hypothetical protein  95 
 
 
50 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0071  hypothetical protein  94.34 
 
 
63 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2180  hypothetical protein  94.34 
 
 
63 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1336  hypothetical protein  94.34 
 
 
63 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0651834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2243  hypothetical protein  94.23 
 
 
63 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74575  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1411  hypothetical protein  87.3 
 
 
63 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.447003  hitchhiker  0.0000125565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  50.85 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  48.33 
 
 
66 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  48.94 
 
 
61 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  48.94 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  49.09 
 
 
66 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  37.7 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  40.98 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  48 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  34.43 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  42.55 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  41.82 
 
 
62 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  42.11 
 
 
60 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  43.64 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  46 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  39.29 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  40.38 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  39.29 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  41.82 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  33.33 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>