55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3794 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3794  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3649  hypothetical protein  92.86 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0695  hypothetical protein  90.28 
 
 		 70 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  68.66 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0435  hypothetical protein  79.1 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.409321  unclonable  0.0000000247595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0359  hypothetical protein  79.1 
 
 		 65 aa  87  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.246304  hitchhiker  0.00315014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3717  hypothetical protein  70.59 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0761314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3915  Protein of unknown function DUF2065  71.64 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0539  hypothetical protein  68.66 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.174202  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3817  conserved hypothetical protein  79.1 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5692  hypothetical protein  79.1 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4707  hypothetical protein  79.1 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4647  hypothetical protein  79.1 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3837  hypothetical protein  79.1 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4735  hypothetical protein  79.1 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4418  hypothetical protein  79.1 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04043  conserved inner membrane protein  81.25 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0161313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04005  hypothetical protein  81.25 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0232137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  49.25 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  48.39 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4762  hypothetical protein  73.13 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4643  hypothetical protein  73.13 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4783  hypothetical protein  73.13 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.107526  normal  0.312124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4726  hypothetical protein  73.13 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  50.94 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  47.17 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  47.17 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000197115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  45.28 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  45.28 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  45.28 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  46.43 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3292  hypothetical protein  47.17 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341896  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0749  hypothetical protein  44 
 
 		 56 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000984241  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3593  hypothetical protein  43.4 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000773085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  43.1 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  39.22 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4220  hypothetical protein  41.51 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000695961  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4633  hypothetical protein  68.89 
 
 		 45 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  51.11 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  47.92 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3650  hypothetical protein  41.46 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000159809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0734  hypothetical protein  41.46 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00001969  hitchhiker  0.0032638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0704  hypothetical protein  41.46 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000186245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  48 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  40.38 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  47.92 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  38.18 
 
 		 62 aa  43.9  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  40.74 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0725  hypothetical protein  39.02 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541071  hitchhiker  0.0000273453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  38.98 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  34.62 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>