29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4633 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4762  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4643  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4633  hypothetical protein  100 
 
 
45 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4783  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.107526  normal  0.312124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4726  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0359  hypothetical protein  73.33 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.246304  hitchhiker  0.00315014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3649  hypothetical protein  68.89 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3794  hypothetical protein  68.89 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0695  hypothetical protein  68.89 
 
 
70 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3717  hypothetical protein  62.22 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0761314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0435  hypothetical protein  62.22 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.409321  unclonable  0.0000000247595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  57.78 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3915  Protein of unknown function DUF2065  57.78 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3817  conserved hypothetical protein  84.44 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5692  hypothetical protein  84.44 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271125  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4707  hypothetical protein  84.44 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4647  hypothetical protein  84.44 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3837  hypothetical protein  84.44 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4735  hypothetical protein  84.44 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4418  hypothetical protein  84.44 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04005  hypothetical protein  82.22 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0232137  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04043  conserved inner membrane protein  82.22 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0161313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0539  hypothetical protein  64.44 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.174202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  47.5 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  45 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  47.5 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  45.24 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  47.22 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000197115  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  41.46 
 
 
62 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>