64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1703 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1703  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  776    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3181  hypothetical protein  64.62 
 
 		 394 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1108  hypothetical protein  36.39 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000291485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0339  hypothetical protein  28.06 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00289774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  23.02 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  27.34 
 
 		 727 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  33.08 
 
 		 896 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  23.08 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  26.42 
 
 		 879 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  23.67 
 
 		 722 aa  63.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  26.24 
 
 		 871 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  27.23 
 
 		 890 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  24.01 
 
 		 886 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  24.01 
 
 		 886 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  27.17 
 
 		 857 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  27.89 
 
 		 755 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  31.11 
 
 		 861 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  24.73 
 
 		 883 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  21.61 
 
 		 876 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  25.64 
 
 		 882 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  31.85 
 
 		 861 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  24.18 
 
 		 878 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  24.32 
 
 		 885 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  23.27 
 
 		 856 aa  53.9  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  23.18 
 
 		 743 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  22 
 
 		 874 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  23.27 
 
 		 730 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  26.6 
 
 		 856 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  25.52 
 
 		 856 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  25.52 
 
 		 865 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  25.79 
 
 		 855 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  25.52 
 
 		 855 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  25.91 
 
 		 855 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  22 
 
 		 874 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  25.91 
 
 		 855 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  27.71 
 
 		 875 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  27.22 
 
 		 723 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  27.22 
 
 		 727 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  29.25 
 
 		 881 aa  50.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  25 
 
 		 877 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  25 
 
 		 877 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  27.01 
 
 		 748 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  26.67 
 
 		 861 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  26.09 
 
 		 730 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  27.83 
 
 		 879 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  23.79 
 
 		 741 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  24.18 
 
 		 894 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  24.39 
 
 		 895 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  29.85 
 
 		 872 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  26.06 
 
 		 906 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7139  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  34.29 
 
 		 447 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  21.78 
 
 		 858 aa  46.2  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  24 
 
 		 939 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  24.36 
 
 		 918 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  23.15 
 
 		 902 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  23.96 
 
 		 856 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  33.33 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  27.69 
 
 		 862 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  26.32 
 
 		 723 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5354  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2,6- diamin opimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  34.29 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000188354  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  27.81 
 
 		 751 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5770  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2,6- diamin opimelate/D-alanyl-D-alanylligase  28.75 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5795  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanylligase  35.82 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10770  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  40.68 
 
 		 495 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>