26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1108 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1108  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  629  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000291485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1703  hypothetical protein  36.39 
 
 
395 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3181  hypothetical protein  31.15 
 
 
394 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0339  hypothetical protein  34.92 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00289774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  27.22 
 
 
861 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  27.33 
 
 
875 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  25.32 
 
 
871 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  28.46 
 
 
741 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  28.29 
 
 
858 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  25.14 
 
 
865 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  25.87 
 
 
856 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  26.47 
 
 
748 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  27.33 
 
 
861 aa  46.2  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  27.38 
 
 
861 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  28.95 
 
 
890 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  26.28 
 
 
855 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  23.84 
 
 
879 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  27.81 
 
 
855 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  25.95 
 
 
872 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  27.81 
 
 
855 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  25.14 
 
 
862 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  27.04 
 
 
856 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  29.85 
 
 
755 aa  43.5  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  27.15 
 
 
856 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  31.15 
 
 
895 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  27.83 
 
 
722 aa  42.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>