44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3181 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3181  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  773    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1703  hypothetical protein  64.62 
 
 		 395 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1108  hypothetical protein  31.15 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000291485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0339  hypothetical protein  27.63 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00289774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  35.11 
 
 		 896 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  29.83 
 
 		 727 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  29.74 
 
 		 879 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  28.8 
 
 		 878 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  27.23 
 
 		 883 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  28.16 
 
 		 886 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  28.16 
 
 		 886 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  27.93 
 
 		 871 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  28.28 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  30.57 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  29.67 
 
 		 748 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  27.12 
 
 		 755 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  26.83 
 
 		 722 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  19.13 
 
 		 584 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  24.06 
 
 		 857 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  26.9 
 
 		 856 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  24.79 
 
 		 730 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  26.61 
 
 		 741 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  23.65 
 
 		 856 aa  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  25.45 
 
 		 751 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  26.34 
 
 		 855 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  20.7 
 
 		 730 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  23.22 
 
 		 858 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  26.53 
 
 		 743 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  25.77 
 
 		 890 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  26.9 
 
 		 855 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  21.77 
 
 		 746 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  26.9 
 
 		 855 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  28.57 
 
 		 856 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  25.97 
 
 		 744 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  25.13 
 
 		 856 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  28.1 
 
 		 906 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  25.26 
 
 		 855 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  28.33 
 
 		 861 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  25.43 
 
 		 882 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  21.08 
 
 		 876 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  26.39 
 
 		 861 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  26.98 
 
 		 875 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  26.23 
 
 		 881 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  26.39 
 
 		 861 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>