129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0850 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  100 
 
 		 71 aa  137  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  55 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3154  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.621454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  50 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  46.48 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  46.48 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  46.48 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  53.57 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  44.29 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  44.29 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1843  50S ribosomal protein L29  46.3 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  43.94 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  44.83 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  45 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  41.82 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0189  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00253702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  38.24 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  41.82 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1930  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  44.83 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2415  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000251007  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  37.25 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2221  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000475867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2288  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000110804  hitchhiker  0.00284339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  35.29 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  38.24 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  40 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  37.29 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>