165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1859 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 74 aa  145  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl131  50S ribosomal protein L29  36.76 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  44.64 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  44.64 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  40.91 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0688  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0406  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  40.91 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  35.71 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  35.71 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  35.71 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  40.91 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3711  ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 74 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  40.91 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  36.49 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  38.24 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  35 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  39.13 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  35 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  43.64 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  36.51 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  41.07 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>