108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3711 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3711  ribosomal protein L29  100 
 
 		 76 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0244  50S ribosomal protein L29  71.43 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0241  50S ribosomal protein L29  71.43 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  78.12 
 
 		 64 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  68.25 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 		 74 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3004  50S ribosomal protein L29P  60.29 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.837477  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1300  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 74 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  45.59 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  45.59 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9845  predicted protein  48.39 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0397388  normal  0.0486336 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  42.65 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17571  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17321  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.221163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  43.94 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17411  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  44.64 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  36.76 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  37.88 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  37.31 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  35.48 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  38.89 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  40.68 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  33.82 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  34.38 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  41.18 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  35.09 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424556  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  32.2 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  33.9 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  32.26 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 78 aa  42  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 78 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  40 
 
 		 109 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  34.43 
 
 		 65 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 79 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  33.9 
 
 		 76 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  40.35 
 
 		 69 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  35 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  36.36 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 83 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  36.84 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  40.91 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  31.82 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  35.19 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>