56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1300 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1300  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
74 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417644  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  55.41 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3711  ribosomal protein L29  50.68 
 
 
76 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  57.81 
 
 
64 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0241  50S ribosomal protein L29  56.34 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  52.7 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0244  50S ribosomal protein L29  57.35 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3004  50S ribosomal protein L29P  45.59 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.837477  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9845  predicted protein  41.94 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0397388  normal  0.0486336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 
65 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17321  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.221163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  37.88 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  34.85 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  35.82 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  35.82 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  35.82 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  35.48 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  32.79 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424556  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17411  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17571  50S ribosomal protein L29  35.48 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  35.85 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  40.32 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
74 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  35.94 
 
 
69 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  36.07 
 
 
69 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 
66 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  34.38 
 
 
83 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  35.59 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  35.48 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  34.48 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0218  ribosomal protein L29  42.31 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  31.15 
 
 
64 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>