146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0459 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 65 aa  127  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  98.46 
 
 		 65 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  96.92 
 
 		 65 aa  124  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  48.39 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  49.21 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  50.82 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  50 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  46.15 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  44.62 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  48.39 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  44.62 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  46.77 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  44.62 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  45.31 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  50.88 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0595  ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  43.75 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  46.77 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  46.15 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  46.15 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  46.15 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  42.19 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6606  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  47.69 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  45 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  49.09 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  43.94 
 
 		 78 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  47.37 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  49.21 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  45 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  53.06 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  45 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3915  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4307  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243874  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  43.75 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2316  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000905483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  41.94 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0413  50S ribosomal protein L29P  36.51 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000118105  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>