258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3897 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 		 80 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  65.33 
 
 		 83 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  70.59 
 
 		 77 aa  99.4  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  69.23 
 
 		 78 aa  96.7  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  70.31 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  73.85 
 
 		 74 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  63.01 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  60 
 
 		 80 aa  93.6  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  65.67 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  67.19 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0595  ribosomal protein L29  67.19 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  74.19 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  74.19 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  60.81 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  62.32 
 
 		 77 aa  90.5  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  63.89 
 
 		 76 aa  89.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  74.6 
 
 		 78 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  61.97 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  71.43 
 
 		 88 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  61.97 
 
 		 77 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  60.29 
 
 		 83 aa  86.7  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  61.97 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  69.84 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  66.67 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  58.67 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  61.19 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  57.33 
 
 		 77 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  57.33 
 
 		 77 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  57.33 
 
 		 77 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  59.09 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6606  ribosomal protein L29  65 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  60.94 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  73.21 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  65.08 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  62.9 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  57.38 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4307  50S ribosomal protein L29  65.38 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243874  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3915  50S ribosomal protein L29  65.38 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  62.3 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  60.66 
 
 		 64 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  61.9 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  59.68 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  57.81 
 
 		 66 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  56.72 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  57.38 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  59.32 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  58.06 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  60.66 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 67 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  54.1 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  53.45 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  58.18 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  64.44 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  54.55 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  44.78 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  55.74 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 67 aa  60.1  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  64.15 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1234  50S ribosomal protein L29P  47.69 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521287  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  49.21 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  49.21 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  50 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  65.12 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>