150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_19951 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 70 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  97.14 
 
 		 70 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  65.22 
 
 		 69 aa  93.6  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  62.32 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  58.57 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 70 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17571  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17411  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  45.71 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17321  50S ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.221163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3711  ribosomal protein L29  45.59 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  44.93 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  42.65 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3004  50S ribosomal protein L29P  47.62 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.837477  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0244  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0241  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  39.71 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1300  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  39.71 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  41.79 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  43.4 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  44.64 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  38.1 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  33.87 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  38.33 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  37.1 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  36.84 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  41.07 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  36.21 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9845  predicted protein  39.66 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0397388  normal  0.0486336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>