76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_17321 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_17321  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 72 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.221163  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  86.11 
 
 		 72 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17571  50S ribosomal protein L29  86.11 
 
 		 72 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17411  50S ribosomal protein L29  83.33 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  54.55 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  54.55 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 70 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3711  ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0244  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0241  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  29.85 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 61 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1300  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3004  50S ribosomal protein L29P  39.66 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.837477  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  36.54 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  39.62 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  31.67 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  38.89 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  29.82 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9845  predicted protein  37.93 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0397388  normal  0.0486336 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  39.22 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  30 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  31.75 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  35.29 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  32.14 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  28.33 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  35.29 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  35.29 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  35.29 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  31.75 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  38.89 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  35.29 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  30.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  28.33 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  30.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  28.33 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  30.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  30.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  36.54 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  28.33 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  27.69 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  30.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  26.67 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 69 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  26.87 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0218  ribosomal protein L29  32.31 
 
 		 66 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  23.44 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  31.58 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  31.67 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  37.25 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  28.57 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  27.87 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  37.25 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0402  50S ribosomal protein L29  35.19 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0377  50S ribosomal protein L29  35.19 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  27.42 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  28.12 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  32.08 
 
 		 67 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  27.42 
 
 		 71 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>