136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0218 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0218  ribosomal protein L29  100 
 
 		 66 aa  124  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  47.37 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  43.14 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  39.62 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  37.29 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  41.07 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  44.64 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  35.09 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 67 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  34.33 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  37.88 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  36.84 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  37.29 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  32.81 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  40.68 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  40.68 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  31.58 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  41.51 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  34.38 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0294  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00124097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  36.21 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04513  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00296689  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  31.82 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  36.84 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0764  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000255511  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1234  50S ribosomal protein L29P  46 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521287  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  34.48 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  36.07 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  35.09 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1938  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2026  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  35 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4268  ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000037065  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1025  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00341949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1941  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  32.73 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  32.73 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  35.59 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  35.59 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  34.55 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 63 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>