154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23101 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 70 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  75.36 
 
 		 69 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  73.91 
 
 		 69 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  65.71 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  58.57 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  60.32 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 72 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3004  50S ribosomal protein L29P  51.39 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.837477  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  52.86 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3711  ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0241  50S ribosomal protein L29  47.14 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17571  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0244  50S ribosomal protein L29  47.14 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17321  50S ribosomal protein L29  55.77 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.221163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17411  50S ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  46.15 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  43.75 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  38.57 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  49.15 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1300  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  44.44 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  40.68 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  36.76 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  42.42 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  38.46 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 71 aa  48.1  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  35.59 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 67 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  35.59 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  39.39 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  40.38 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  40.35 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>