159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1121 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 70 aa  136  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  97.14 
 
 		 70 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  63.77 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  60.87 
 
 		 69 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  58.57 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17571  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17411  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  45.71 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17321  50S ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.221163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3711  ribosomal protein L29  45.59 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  44.93 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  42.65 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3004  50S ribosomal protein L29P  46.03 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.837477  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1300  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  40.58 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  39.71 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0244  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0241  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  39.71 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  44.64 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  38.81 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  39.68 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  38.81 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  35.09 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0688  50S ribosomal protein L29  42.25 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  38.33 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  32.26 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  38.98 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  36.51 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9845  predicted protein  39.66 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0397388  normal  0.0486336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  42.31 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  35.59 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>