86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16701 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  65.71 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  60.87 
 
 		 69 aa  90.1  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 70 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  58.57 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  56.25 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  47.83 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17571  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17411  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17321  50S ribosomal protein L29  59.26 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.221163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3004  50S ribosomal protein L29P  43.48 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.837477  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3711  ribosomal protein L29  42.65 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0241  50S ribosomal protein L29  41.43 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0244  50S ribosomal protein L29  41.43 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  46.3 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  44.44 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  36.76 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  44.07 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  48.08 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 74 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1300  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  38.24 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  35.29 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  35.29 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  35.82 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  43.4 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  43.4 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  34.33 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  41.51 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  44.23 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  41.51 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  41.51 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  41.51 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  39.62 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  42.31 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  36.84 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  37.5 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  35.94 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  42.31 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  35.59 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  43.4 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  39.62 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  40.38 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  39.62 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  39.62 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  36.84 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 76 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 71 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  38.6 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 65 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424556  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  35.09 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  36.76 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  37.74 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  35.85 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>