78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1642 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 72 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17571  50S ribosomal protein L29  93.06 
 
 		 72 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17411  50S ribosomal protein L29  90.28 
 
 		 72 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17321  50S ribosomal protein L29  90 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.221163  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 70 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  57.69 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3711  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  38.24 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0244  50S ribosomal protein L29  36.62 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  36.23 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  32.84 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0241  50S ribosomal protein L29  35.21 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  28.57 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3004  50S ribosomal protein L29P  36.62 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.837477  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  26.76 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1300  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  38.89 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  29.51 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0218  ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  28.99 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  30 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  34.62 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  39.22 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  32.69 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  33.33 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  30.65 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  33.96 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  29.82 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9845  predicted protein  34.43 
 
 		 62 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0397388  normal  0.0486336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  29.03 
 
 		 71 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  28.33 
 
 		 77 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  31.67 
 
 		 69 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  29.03 
 
 		 71 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  29.03 
 
 		 71 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  32.69 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  29.03 
 
 		 71 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  26.67 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  26.67 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  26.67 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  37.04 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  37.25 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  32.08 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  32.08 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  26.67 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  30 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  26.92 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  37.25 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  27.87 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  29.69 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  32.76 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  29.31 
 
 		 66 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>