145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0368 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0368  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 69 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  88.41 
 
 		 69 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  75.36 
 
 		 70 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  62.32 
 
 		 70 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  60.87 
 
 		 70 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  60.87 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  57.81 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  47.83 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3711  ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0241  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0244  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 78 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3004  50S ribosomal protein L29P  46.88 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.837477  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17321  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.221163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1300  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1642  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17571  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  45.59 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17411  50S ribosomal protein L29  48.08 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  40.3 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  40 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  45.76 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  37.68 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  40.35 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  43.75 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  34.78 
 
 		 74 aa  47.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  37.29 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  35.94 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 71 aa  47.4  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  42.31 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  39.34 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  34.48 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  43.4 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  45.28 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>