192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2899 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  100 
 
 
65 aa  128  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  73.85 
 
 
74 aa  97.1  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 
74 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  46.15 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl131  50S ribosomal protein L29  46.15 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0688  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 
138 aa  57.8  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  53.33 
 
 
69 aa  57.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0699  50S ribosomal protein L29  46.15 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000396079  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  51.67 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
68 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
74 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
74 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
74 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  42.19 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  44.64 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  44.64 
 
 
70 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  45.61 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23101  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 
65 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  44.64 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
77 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  44.83 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  49.09 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  41.67 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  42.42 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  44.26 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  38.1 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  43.08 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  43.64 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
67 aa  48.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
72 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  43.86 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  43.64 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  43.33 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1963  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2567  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0244  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
78 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
66 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
69 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0241  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
78 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  39.34 
 
 
70 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  43.64 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
68 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  41.07 
 
 
80 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  43.64 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6606  ribosomal protein L29  53.85 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  43.64 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  53.85 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2224  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.839547  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  41.94 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  43.33 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  40.35 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>