139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0273 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  100 
 
 		 66 aa  127  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  42.62 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  45.9 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  45.9 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 63 aa  50.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  45.9 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1938  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1941  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  44.62 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2026  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  44.26 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  40 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  45.45 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  44.26 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  44.44 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  37.88 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01228  60S ribosomal protein L35 (AFU_orthologue; AFUA_1G10510)  46.15 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.685819 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0294  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00124097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  41.67 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2899  ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0098  50S ribosomal protein L29P  38.33 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000337188  unclonable  0.000000412154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  35.94 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  35.94 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  42.42 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3787  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0936197  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  35.94 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  39.39 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4268  ribosomal protein L29  40 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000037065  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  40 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0434  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157908  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  40 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  35.94 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0042  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3516  ribosomal protein L29  40 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000165704  hitchhiker  0.00000095159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0346  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.767822  decreased coverage  0.000256062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3435  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.041073  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  38.71 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0399  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3991  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000636565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  40 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07490  ribosomal protein L35, putative  45.31 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0097389  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  37.29 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>