169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0434 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0434  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 64 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157908  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0497  50S ribosomal protein L29  88.89 
 
 		 65 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000428226  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0492  50S ribosomal protein L29  88.89 
 
 		 65 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000269132  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1769  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000104669  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  51.67 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4268  ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000037065  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0429  50S ribosomal protein L29P  53.33 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.164508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0462  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748609  hitchhiker  0.00000252348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0402  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0377  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  43.75 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0328  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000164942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04513  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00296689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2316  ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000905483  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  45 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3901  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00385077  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0865  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.8068  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2166  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0764  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000255511  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00738  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3787  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0936197  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03163  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00161399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0401  ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000919914  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0401  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000329963  hitchhiker  0.0000645786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3607  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000124478  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0477  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0320734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0502  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00942547  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0331  ribosomal protein L29  45 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000295668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4635  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000441605  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0850  50S ribosomal protein L29  49.21 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3697  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000365786  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03114  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00150195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3506  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3795  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000391075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0441  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0221163  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3516  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000165704  hitchhiker  0.00000095159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1272  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0592  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000721048  normal  0.404222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0287  50S ribosomal protein L29P  45.31 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866901  hitchhiker  0.00000164935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0291  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4536  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000789645  hitchhiker  0.00157361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3907  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000021139  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1025  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00341949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0399  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0211  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3435  50S ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.041073  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3011  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000636591  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  45 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3743  50S ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000379102  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0281  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000262471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0346  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.767822  decreased coverage  0.000256062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0286  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676877  hitchhiker  0.0000000263435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3799  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3701  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000648368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3736  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0036533  normal  0.0206693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>