67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1769 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1769  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 64 aa  126  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000104669  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1025  50S ribosomal protein L29  85.25 
 
 		 61 aa  105  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00341949  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0067  50S ribosomal protein L29  77.97 
 
 		 61 aa  94.4  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00273848  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1867  50S ribosomal protein L29  75.41 
 
 		 61 aa  93.6  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2073  50S ribosomal protein L29  75.41 
 
 		 61 aa  93.6  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1696  50S ribosomal protein L29  75.41 
 
 		 61 aa  93.6  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00133107  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0042  50S ribosomal protein L29  73.77 
 
 		 61 aa  92  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118761  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1960  ribosomal protein L29  76.27 
 
 		 62 aa  89.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.430573  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0294  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00124097  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0434  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157908  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0092  50S ribosomal protein L29  75.41 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.786092  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0497  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000428226  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0492  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000269132  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3516  ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000165704  hitchhiker  0.00000095159 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0287  50S ribosomal protein L29P  37.93 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866901  hitchhiker  0.00000164935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3289  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000215489  hitchhiker  0.00000182798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3011  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000636591  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2942  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000229225  hitchhiker  0.00000342543 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  49.02 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  40.3 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 65 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0327  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 64 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.65874e-22  unclonable  0.0000000398692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  38.98 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  38.98 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  40.32 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4268  ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000037065  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  45.1 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>