279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2316 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2316  ribosomal protein L29  100 
 
 		 66 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000905483  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  68.33 
 
 		 63 aa  76.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  53.03 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  63.33 
 
 		 63 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 63 aa  67  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2832  50S ribosomal protein L29  56.25 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000129889  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  60 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  50 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0322  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000137645  decreased coverage  0.00229804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3636  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  decreased coverage  0.00000000000115697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0287  50S ribosomal protein L29P  52.31 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866901  hitchhiker  0.00000164935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0441  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0221163  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0502  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00942547  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  54.1 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3738  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000269759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3486  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000914257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2624  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.319258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3768  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000105209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3455  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  decreased coverage  0.00364799 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3796  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3060  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000156067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0335  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000122941  normal  0.019257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2751  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000361638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0275  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000476905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0257  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00213265  normal  0.0167068 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0284  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204837  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0356  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000200225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3161  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1932  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000362681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4268  ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000037065  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3516  ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000165704  hitchhiker  0.00000095159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0764  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000255511  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  46.15 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0331  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000295668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0462  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748609  hitchhiker  0.00000252348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04513  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00296689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0336  ribosomal protein L29  58.93 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.296704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  42.42 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3011  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000636591  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00738  50S ribosomal protein L29  65 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3991  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000636565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3289  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000215489  hitchhiker  0.00000182798 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2942  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000229225  hitchhiker  0.00000342543 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>