81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0098 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0098  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 
68 aa  127  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000337188  unclonable  0.000000412154 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0487  ribosomal protein L29  48.44 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  44.07 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  38.71 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1771  ribosomal protein L29  60 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  40.98 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 
66 aa  48.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 
66 aa  48.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  43.08 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  41.38 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  38.1 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  41.67 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  41.38 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  40.32 
 
 
67 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  35 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  40.68 
 
 
83 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  36.51 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  41.67 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  37.29 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  38.6 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  38.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  37.29 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  37.29 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  34.92 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  42.11 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  37.29 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  38.89 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl131  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  34.48 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  35.59 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  37.29 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  38.46 
 
 
71 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  38.46 
 
 
71 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  35.19 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  35.71 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  35.71 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  37.93 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2026  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 
73 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1938  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 
73 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1941  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 
73 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  34.43 
 
 
66 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  40 
 
 
68 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  36.54 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  35 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  35.59 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0218  ribosomal protein L29  36.21 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  37.93 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  36.07 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  33.87 
 
 
68 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
69 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  33.33 
 
 
71 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
69 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>