28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_01228 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01228  60S ribosomal protein L35 (AFU_orthologue; AFUA_1G10510)  100 
 
 		 124 aa  247  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.685819 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07490  ribosomal protein L35, putative  65.85 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0097389  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85685  predicted protein  58.33 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31613  Ribosomal protein L35, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  52.5 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0013308 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19615  predicted protein  50.83 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  44.07 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  46.15 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  38.98 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  38.98 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 67 aa  43.5  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  37.93 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  41.94 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 69 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  43.1 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  48.15 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 78 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  47.17 
 
 		 68 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>