42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3154 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3154  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 62 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.621454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  58.06 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  62.3 
 
 		 62 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  60.66 
 
 		 64 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  60 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  51.92 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05755  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1930  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  45 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  40 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1155  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000143802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  35 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  36.67 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  33.87 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  33.33 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  38.18 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 68 aa  40  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>