54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4351 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  100 
 
 		 64 aa  124  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  60.32 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3154  50S ribosomal protein L29  60.66 
 
 		 62 aa  73.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.621454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  53.45 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05755  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  38.33 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  42.31 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1155  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000143802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  35.09 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  40.68 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  38.18 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  33.93 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  36.07 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  40 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  36.67 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  31.67 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  37.04 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1410  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 67 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 68 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  32.76 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  33.82 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  32.73 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  32.73 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  35.09 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  35.71 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  32.69 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  32.08 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  40.35 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>