35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0189 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
62 aa  121  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3154  50S ribosomal protein L29  62.3 
 
 
62 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.621454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  50 
 
 
64 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  61.82 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  51.61 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  45 
 
 
71 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  49.02 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 
63 aa  52.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1930  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 
64 aa  52  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1155  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000143802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  42.11 
 
 
69 aa  47.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05755  50S ribosomal protein L29  34.48 
 
 
67 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  41.67 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1843  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  33.33 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  40.35 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  35.09 
 
 
71 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  36.67 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2288  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000110804  hitchhiker  0.00284339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  36.67 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  38.33 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>