42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1155 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1155  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
63 aa  127  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000143802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  69.84 
 
 
63 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05755  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 
67 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  45.16 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  46.03 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3154  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.621454 
 
 
-
 
NC_002950  PG1930  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 
67 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
69 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  37.93 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  39.66 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  40.32 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  38.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  39.62 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  39.66 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  41.51 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  37.74 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  39.68 
 
 
69 aa  41.2  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  35.48 
 
 
64 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 
68 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>