42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0610 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  100 
 
 		 69 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3154  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 62 aa  70.5  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.621454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  61.82 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1155  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000143802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  42.11 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05755  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  36.67 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  36.23 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  40 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  39.34 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  38.33 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  40 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0189  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00253702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  32.31 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2288  50S ribosomal protein L29  35.82 
 
 		 68 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000110804  hitchhiker  0.00284339 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2221  50S ribosomal protein L29  32.84 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000475867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  35.48 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  34.78 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  32.76 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 79 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>