72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05755 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05755  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 67 aa  131  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 63 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1155  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000143802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1930  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3154  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.621454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  38.1 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  41.27 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  37.5 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  34.48 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 62 aa  42  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  36.67 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  41.79 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  35.94 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 77 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  35.94 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  39.68 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  39.22 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  35.94 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  46 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  31.75 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>