38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1930 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1930  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 64 aa  128  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05755  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3154  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.621454 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 63 aa  52  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  39.68 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1155  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000143802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  35.48 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 		 69 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 		 69 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 		 69 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  34.38 
 
 		 83 aa  40  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>