265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0716 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  100 
 
 		 62 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  54.24 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  50.85 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  44.64 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  43.1 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  50.88 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  39.34 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  45 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  45 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  45 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  50.85 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  44.23 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  52.83 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  46.43 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  44.23 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  44.23 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0462  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748609  hitchhiker  0.00000252348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  42.31 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  50.94 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  45.28 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 69 aa  50.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>