12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0189 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0189  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
68 aa  138  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00253702  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2415  50S ribosomal protein L29  73.53 
 
 
68 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000251007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0297  50S ribosomal protein L29  76.56 
 
 
68 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2221  50S ribosomal protein L29  79.69 
 
 
68 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000475867  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1843  50S ribosomal protein L29  73.44 
 
 
65 aa  100  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177502  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  71.88 
 
 
68 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2288  50S ribosomal protein L29  77.05 
 
 
68 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000110804  hitchhiker  0.00284339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  45.45 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  40.68 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  37.1 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  37.74 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  35.59 
 
 
69 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>