17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2288 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2288  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000110804  hitchhiker  0.00284339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0189  50S ribosomal protein L29  77.05 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00253702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  66.18 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2415  50S ribosomal protein L29  70 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000251007  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1843  50S ribosomal protein L29  70 
 
 		 65 aa  89.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177502  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0297  50S ribosomal protein L29  68.33 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2221  50S ribosomal protein L29  67.69 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000475867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  35.82 
 
 		 69 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 62 aa  40.8  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  35.48 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  38.24 
 
 		 72 aa  40  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>