14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2415 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2415  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000251007  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1843  50S ribosomal protein L29  82.81 
 
 		 65 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177502  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0189  50S ribosomal protein L29  73.53 
 
 		 68 aa  110  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00253702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2221  50S ribosomal protein L29  76.47 
 
 		 68 aa  110  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000475867  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0297  50S ribosomal protein L29  76.92 
 
 		 68 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  75.38 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2288  50S ribosomal protein L29  70 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000110804  hitchhiker  0.00284339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  40 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  41.51 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  35.59 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>