29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1843 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1843  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177502  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2415  50S ribosomal protein L29  82.81 
 
 		 68 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000251007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0297  50S ribosomal protein L29  76.56 
 
 		 68 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2221  50S ribosomal protein L29  76.56 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000475867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0189  50S ribosomal protein L29  73.44 
 
 		 68 aa  100  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00253702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  70.31 
 
 		 68 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2288  50S ribosomal protein L29  70 
 
 		 68 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000110804  hitchhiker  0.00284339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  46.3 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  38.89 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  38.98 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>