16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2056 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2415  50S ribosomal protein L29  75.38 
 
 
68 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000251007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2221  50S ribosomal protein L29  75.38 
 
 
68 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000475867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0189  50S ribosomal protein L29  71.88 
 
 
68 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00253702  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0297  50S ribosomal protein L29  69.23 
 
 
68 aa  98.2  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1843  50S ribosomal protein L29  70.31 
 
 
65 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177502  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2288  50S ribosomal protein L29  66.18 
 
 
68 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000110804  hitchhiker  0.00284339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  40.35 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  40.68 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  38.98 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  41.82 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  38.6 
 
 
64 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  40.98 
 
 
65 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1155  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 
63 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000143802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>