121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1923 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  100 
 
 
338 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  88.24 
 
 
336 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  59.88 
 
 
330 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  60.35 
 
 
341 aa  335  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1548  protein of unknown function DUF808  61.26 
 
 
331 aa  325  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  hitchhiker  0.00682503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2082  protein of unknown function DUF808  62.99 
 
 
330 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1746  hypothetical protein  62.69 
 
 
330 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  58.43 
 
 
345 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1388  hypothetical protein  59.2 
 
 
323 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  50.15 
 
 
313 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  56.88 
 
 
315 aa  276  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  59.43 
 
 
322 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  56.39 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  54.93 
 
 
311 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  52.53 
 
 
316 aa  272  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  53.57 
 
 
314 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2958  hypothetical protein  57.54 
 
 
323 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1603  hypothetical protein  57.85 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499282  normal  0.0520062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  55.29 
 
 
314 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  49.1 
 
 
313 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  50.16 
 
 
324 aa  251  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  48.53 
 
 
364 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  50.82 
 
 
361 aa  249  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4402  hypothetical protein  56.77 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.976692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  48.46 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  53.04 
 
 
327 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  53.04 
 
 
327 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  53.04 
 
 
327 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  49.83 
 
 
339 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  50 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  50.16 
 
 
317 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1616  protein of unknown function DUF808  46.15 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  50.34 
 
 
320 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1431  hypothetical protein  50.34 
 
 
314 aa  222  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  51.16 
 
 
317 aa  222  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  47.12 
 
 
366 aa  222  7e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  46.93 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  45.6 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  45.28 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  45.45 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  45.13 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  46.1 
 
 
307 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  45.45 
 
 
308 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  46.48 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  46.34 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  46.69 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  43.45 
 
 
307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  45.03 
 
 
306 aa  212  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  45.45 
 
 
311 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  43.69 
 
 
314 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  43.29 
 
 
307 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  41.36 
 
 
311 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  42.95 
 
 
310 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  41.72 
 
 
321 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  41.61 
 
 
301 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  44.63 
 
 
311 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  42.63 
 
 
309 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  43.04 
 
 
301 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13109  integral membrane protein  46.25 
 
 
306 aa  202  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0328248  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  44.48 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  42.43 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  42.12 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  43.37 
 
 
310 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  45.36 
 
 
305 aa  200  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  45.36 
 
 
305 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  43.26 
 
 
311 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  45.36 
 
 
305 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  45.36 
 
 
305 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  45.36 
 
 
305 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  45.36 
 
 
303 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  45.36 
 
 
305 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0752  hypothetical protein  43.85 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  43.09 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  43.09 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  43.09 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  43.09 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  43.09 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  45.83 
 
 
332 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  41.85 
 
 
302 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1870  hypothetical protein  51.1 
 
 
337 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  45.83 
 
 
332 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  44.86 
 
 
302 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  43.83 
 
 
319 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  45.07 
 
 
325 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  41.83 
 
 
307 aa  196  7e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  48.45 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  40.79 
 
 
341 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1061  hypothetical protein  44.66 
 
 
312 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  44.77 
 
 
304 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  43.96 
 
 
307 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  44.44 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  42.77 
 
 
305 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  44.23 
 
 
304 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  41.41 
 
 
304 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  42.01 
 
 
303 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4423  protein of unknown function DUF808  51.54 
 
 
320 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  40.65 
 
 
314 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  46.56 
 
 
328 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  42.02 
 
 
308 aa  185  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  43.63 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.856782 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>