121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1746 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1746  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2082  protein of unknown function DUF808  98.48 
 
 		 330 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1548  protein of unknown function DUF808  84.64 
 
 		 331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  hitchhiker  0.00682503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  62.84 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  62.99 
 
 		 338 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  63.55 
 
 		 336 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  61.01 
 
 		 322 aa  315  7e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  57.05 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  54.28 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  59.43 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  57.14 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  53.82 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  51.63 
 
 		 313 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  54.64 
 
 		 313 aa  278  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  54.57 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  57.93 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  50.33 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  58.71 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  53.69 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1388  hypothetical protein  58.7 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  46.97 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  50 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4402  hypothetical protein  58.28 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.976692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2958  hypothetical protein  56.66 
 
 		 323 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1603  hypothetical protein  56.66 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499282  normal  0.0520062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  50 
 
 		 305 aa  251  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  49.5 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  55.36 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  50.99 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  53.58 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  53.58 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  53.58 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  49.85 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  52.01 
 
 		 317 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1431  hypothetical protein  51.03 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  44.22 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  44.14 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1616  protein of unknown function DUF808  45.78 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  43.83 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  43.43 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  45.83 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  43.93 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  43.42 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  43.17 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  42.24 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0752  hypothetical protein  45.3 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  42.61 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  44.19 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  45.07 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  44.6 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  41.72 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  43.28 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  45.67 
 
 		 304 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22260  hypothetical protein  50.61 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  44.6 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  44.88 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  43.99 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  41.77 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1870  hypothetical protein  49.36 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  44.88 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  45.33 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  43.42 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  44.88 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  44.88 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  44.88 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  44.88 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  44.88 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  43.13 
 
 		 308 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  44.88 
 
 		 305 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  46.08 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  48.25 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  42.36 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  48.25 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  42.42 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  45.31 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  45.39 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  42.72 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  42.3 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  42.3 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  42.81 
 
 		 303 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  42.3 
 
 		 303 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  46.26 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  40.85 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  42.3 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  41.88 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  42.49 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  42.31 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  44.53 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  40.69 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  46.12 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  44.44 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  42.53 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  41.77 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4423  protein of unknown function DUF808  52.01 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  48.64 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  41.61 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  46.31 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  45.88 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  43.55 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  42.19 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>